Kenichiro Takahashi, Atsushi Nishida, Takehide Fujimoto, Makoto Fujii, Makoto Shioya, Hirotsugu Imaeda, Osamu Inatomi, Shigeki Bamba, Akira Andoh, Mitsushige Sugimoto; Reducción de la abundancia de especies de bacterias productoras de butirato en la comunidad microbiana fecal en la enfermedad de Crohn. Digestión 1 de enero de 2016; 93 (1): 59–65. https://doi.org/10.1159/000441768
Abstracto
Fondo: La alteración global de la comunidad microbiana intestinal (disbiosis) desempeña un papel importante en la patogénesis de las enfermedades inflamatorias intestinales (EII). Sin embargo, las especies bacterianas que caracterizan la disbiosis en la EII siguen sin estar claras. En este estudio, evaluamos la alteración del perfil de la microbiota fecal en pacientes con enfermedad de Crohn (EC) mediante secuenciación del ARNr 16S. Resumen: Las muestras fecales de 10 pacientes con EC inactivos y 10 individuos sanos se sometieron a secuenciación de ARNr 16S. Las regiones hipervariables V3-V4 del ARNr 16S fueron secuenciadas por el sistema Illumina MiSeq™II. El promedio de 62.201 lecturas por muestra de CD fue significativamente más bajo que el promedio de 73.716 lecturas por muestra de control. Los géneros Bacteroides, Eubacterium, Faecalibacterium y Ruminococcus disminuyeron significativamente en los pacientes con EC en comparación con los controles sanos. Por el contrario, los géneros Actinomyces y Bifidobacterium aumentaron significativamente en los pacientes con EC. A nivel de especies, las especies bacterianas productoras de butirato, como Blautia faecis, Roseburia inulinivorans, Ruminococcus torques, Clostridium lavalense, Bacteroides uniformis y Faecalibacterium prausnitzii se redujeron significativamente en los pacientes con EC en comparación con los individuos sanos (p < 0,05). Estos resultados de la secuenciación del ARNr 16S se confirmaron en pacientes con EC adicionales (n = 68) y en controles sanos (n = 46) mediante PCR cuantitativa. La abundancia de Roseburia inulinivorans y torques de Ruminococcus fue significativamente menor en los pacientes con EC positiva para proteína C reactiva (PCR) en comparación con los pacientes con EC negativa para PCR (p < 0,05). Mensaje clave: La disbiosis de los pacientes con EC se caracteriza por una menor abundancia de múltiples especies de bacterias productoras de butirato.
